Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRNP1Q6NT89 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms