Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM208BQ5VWN6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM208BQ5VWN6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM208BQ5VWN6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM208BQ5VWN6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM208BQ5VWN6 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM208BQ5VWN6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM208BQ5VWN6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM208BQ5VWN6 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM208BQ5VWN6 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM208BQ5VWN6 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM208BQ5VWN6 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM208BQ5VWN6 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM208BQ5VWN6 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FAM208BQ5VWN6 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FAM208BQ5VWN6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM208BQ5VWN6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM208BQ5VWN6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM208BQ5VWN6 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FAM208BQ5VWN6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM208BQ5VWN6 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM208BQ5VWN6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM208BQ5VWN6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM208BQ5VWN6 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM208BQ5VWN6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM208BQ5VWN6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms