Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms