Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms