Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms