Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms