Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms