Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
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PTPROQ16827 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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PTPROQ16827 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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PTPROQ16827 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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PTPROQ16827 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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