Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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NDUFA9Q16795 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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NDUFA9Q16795 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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NDUFA9Q16795 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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NDUFA9Q16795 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
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