Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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