Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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ECM1Q16610 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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ECM1Q16610 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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