Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
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GRIK5Q16478 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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GRIK5Q16478 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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GRIK5Q16478 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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GRIK5Q16478 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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GRIK5Q16478 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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GRIK5Q16478 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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GRIK5Q16478 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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GRIK5Q16478 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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GRIK5Q16478 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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