Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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