Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms