Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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