Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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COL19A1Q14993 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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COL19A1Q14993 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
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COL19A1Q14993 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
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COL19A1Q14993 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms