Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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