Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIN2CQ14957 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms