Protein–RNA interactions for Protein: Q14515

SPARCL1, SPARC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPARCL1Q14515 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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