Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CSHL1Q14406 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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