Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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ITGA9Q13797 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
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ITGA9Q13797 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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ITGA9Q13797 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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ITGA9Q13797 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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ITGA9Q13797 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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ITGA9Q13797 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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ITGA9Q13797 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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ITGA9Q13797 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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ITGA9Q13797 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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