Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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