Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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