Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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