Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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