Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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PMS2P3Q13401 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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PMS2P3Q13401 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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PMS2P3Q13401 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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PMS2P3Q13401 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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