Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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