Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP140Q13342 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SP140Q13342 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP140Q13342 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP140Q13342 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP140Q13342 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP140Q13342 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP140Q13342 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SP140Q13342 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP140Q13342 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP140Q13342 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SP140Q13342 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP140Q13342 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SP140Q13342 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP140Q13342 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP140Q13342 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP140Q13342 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP140Q13342 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP140Q13342 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP140Q13342 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP140Q13342 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP140Q13342 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP140Q13342 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP140Q13342 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP140Q13342 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP140Q13342 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP140Q13342 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP140Q13342 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP140Q13342 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP140Q13342 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP140Q13342 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP140Q13342 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP140Q13342 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP140Q13342 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP140Q13342 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP140Q13342 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP140Q13342 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP140Q13342 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP140Q13342 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP140Q13342 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP140Q13342 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SP140Q13342 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP140Q13342 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP140Q13342 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP140Q13342 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP140Q13342 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP140Q13342 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP140Q13342 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP140Q13342 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP140Q13342 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP140Q13342 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP140Q13342 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP140Q13342 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP140Q13342 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP140Q13342 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP140Q13342 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP140Q13342 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP140Q13342 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP140Q13342 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP140Q13342 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP140Q13342 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP140Q13342 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SP140Q13342 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP140Q13342 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SP140Q13342 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SP140Q13342 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SP140Q13342 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SP140Q13342 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SP140Q13342 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SP140Q13342 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SP140Q13342 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SP140Q13342 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SP140Q13342 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SP140Q13342 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SP140Q13342 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SP140Q13342 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SP140Q13342 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SP140Q13342 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SP140Q13342 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SP140Q13342 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SP140Q13342 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SP140Q13342 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SP140Q13342 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SP140Q13342 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SP140Q13342 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SP140Q13342 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SP140Q13342 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SP140Q13342 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SP140Q13342 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SP140Q13342 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SP140Q13342 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SP140Q13342 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SP140Q13342 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SP140Q13342 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SP140Q13342 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SP140Q13342 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SP140Q13342 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SP140Q13342 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SP140Q13342 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SP140Q13342 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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