Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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