Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms