Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
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