Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
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