Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB2Q08289 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB2Q08289 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB2Q08289 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB2Q08289 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB2Q08289 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB2Q08289 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB2Q08289 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB2Q08289 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB2Q08289 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB2Q08289 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB2Q08289 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB2Q08289 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB2Q08289 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB2Q08289 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB2Q08289 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB2Q08289 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB2Q08289 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB2Q08289 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB2Q08289 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB2Q08289 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB2Q08289 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB2Q08289 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB2Q08289 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB2Q08289 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB2Q08289 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB2Q08289 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms