Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 PIN4-203ENST00000373669 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 ETFRF1-201ENST00000381356 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 ADAL-204ENST00000562188 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AL353770.4-202ENST00000621296 1126 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 BX005040.1-201ENST00000622281 1126 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 SNTG1-202ENST00000518864 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 RPS3AP29-201ENST00000437728 769 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms