Protein–RNA interactions for Protein: Q03591

CFHR1, Complement factor H-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR1Q03591 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms