Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 SNHG26-202ENST00000422542 1106 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 AC139099.1-204ENST00000575205 425 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 AC079336.6-201ENST00000624836 613 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 LINC01763-201ENST00000425185 1547 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 AMTN-201ENST00000339336 1037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 SPCS1-202ENST00000423431 822 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 AC021146.11-201ENST00000503319 491 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 C2orf76-203ENST00000409523 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 NIF3L1-206ENST00000416651 967 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 CT45A11P-201ENST00000448043 1134 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 VEPH1-219ENST00000537559 992 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms