Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms