Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms