Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms