Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CABP4P57796 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CABP4P57796 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CABP4P57796 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CABP4P57796 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CABP4P57796 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CABP4P57796 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CABP4P57796 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CABP4P57796 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CABP4P57796 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CABP4P57796 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CABP4P57796 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CABP4P57796 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CABP4P57796 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CABP4P57796 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CABP4P57796 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CABP4P57796 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CABP4P57796 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CABP4P57796 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CABP4P57796 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CABP4P57796 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CABP4P57796 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CABP4P57796 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CABP4P57796 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CABP4P57796 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CABP4P57796 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CABP4P57796 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CABP4P57796 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CABP4P57796 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CABP4P57796 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CABP4P57796 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CABP4P57796 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CABP4P57796 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CABP4P57796 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CABP4P57796 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CABP4P57796 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CABP4P57796 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CABP4P57796 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CABP4P57796 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CABP4P57796 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CABP4P57796 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CABP4P57796 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CABP4P57796 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CABP4P57796 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CABP4P57796 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CABP4P57796 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CABP4P57796 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CABP4P57796 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CABP4P57796 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CABP4P57796 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CABP4P57796 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CABP4P57796 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CABP4P57796 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CABP4P57796 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CABP4P57796 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CABP4P57796 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CABP4P57796 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CABP4P57796 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CABP4P57796 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CABP4P57796 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CABP4P57796 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CABP4P57796 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CABP4P57796 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CABP4P57796 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CABP4P57796 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CABP4P57796 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CABP4P57796 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CABP4P57796 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CABP4P57796 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CABP4P57796 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CABP4P57796 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CABP4P57796 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CABP4P57796 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CABP4P57796 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CABP4P57796 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CABP4P57796 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CABP4P57796 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CABP4P57796 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CABP4P57796 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CABP4P57796 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CABP4P57796 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CABP4P57796 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CABP4P57796 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CABP4P57796 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CABP4P57796 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CABP4P57796 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CABP4P57796 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CABP4P57796 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CABP4P57796 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CABP4P57796 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CABP4P57796 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CABP4P57796 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CABP4P57796 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CABP4P57796 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CABP4P57796 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CABP4P57796 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CABP4P57796 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CABP4P57796 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CABP4P57796 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CABP4P57796 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms