Protein–RNA interactions for Protein: P53597

SUCLG1, Succinate--CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG1P53597 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUCLG1P53597 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUCLG1P53597 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUCLG1P53597 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUCLG1P53597 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUCLG1P53597 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms