Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMSP52788 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMSP52788 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMSP52788 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMSP52788 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMSP52788 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMSP52788 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMSP52788 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMSP52788 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMSP52788 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMSP52788 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMSP52788 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMSP52788 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMSP52788 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMSP52788 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMSP52788 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMSP52788 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMSP52788 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMSP52788 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMSP52788 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMSP52788 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMSP52788 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMSP52788 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMSP52788 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMSP52788 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMSP52788 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMSP52788 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMSP52788 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMSP52788 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMSP52788 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMSP52788 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMSP52788 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMSP52788 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMSP52788 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMSP52788 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMSP52788 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMSP52788 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMSP52788 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMSP52788 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMSP52788 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMSP52788 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMSP52788 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMSP52788 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMSP52788 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMSP52788 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMSP52788 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMSP52788 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMSP52788 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMSP52788 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMSP52788 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMSP52788 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMSP52788 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMSP52788 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMSP52788 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMSP52788 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMSP52788 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMSP52788 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMSP52788 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMSP52788 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMSP52788 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMSP52788 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMSP52788 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMSP52788 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMSP52788 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMSP52788 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMSP52788 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMSP52788 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMSP52788 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMSP52788 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMSP52788 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMSP52788 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMSP52788 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMSP52788 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SMSP52788 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMSP52788 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMSP52788 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMSP52788 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMSP52788 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SMSP52788 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMSP52788 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMSP52788 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMSP52788 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMSP52788 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMSP52788 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMSP52788 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMSP52788 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMSP52788 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMSP52788 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMSP52788 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMSP52788 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMSP52788 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMSP52788 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMSP52788 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SMSP52788 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMSP52788 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMSP52788 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMSP52788 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMSP52788 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMSP52788 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMSP52788 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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