Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2A2P52657 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2A2P52657 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2A2P52657 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2A2P52657 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2A2P52657 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2A2P52657 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2A2P52657 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2A2P52657 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2A2P52657 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2A2P52657 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2A2P52657 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2A2P52657 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2A2P52657 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2A2P52657 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2A2P52657 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2A2P52657 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2A2P52657 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2A2P52657 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2A2P52657 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2A2P52657 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2A2P52657 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2A2P52657 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2A2P52657 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2A2P52657 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2A2P52657 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2A2P52657 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2A2P52657 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2A2P52657 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2A2P52657 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2A2P52657 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2A2P52657 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2A2P52657 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2A2P52657 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF2A2P52657 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF2A2P52657 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF2A2P52657 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF2A2P52657 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF2A2P52657 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF2A2P52657 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF2A2P52657 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF2A2P52657 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF2A2P52657 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF2A2P52657 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF2A2P52657 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF2A2P52657 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF2A2P52657 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2A2P52657 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2A2P52657 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2A2P52657 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2A2P52657 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2A2P52657 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2A2P52657 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2A2P52657 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2A2P52657 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2A2P52657 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2A2P52657 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2A2P52657 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2A2P52657 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2A2P52657 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2A2P52657 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2A2P52657 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2A2P52657 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A2P52657 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A2P52657 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A2P52657 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A2P52657 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A2P52657 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A2P52657 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A2P52657 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A2P52657 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A2P52657 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A2P52657 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A2P52657 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A2P52657 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A2P52657 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A2P52657 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A2P52657 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A2P52657 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A2P52657 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A2P52657 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A2P52657 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A2P52657 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A2P52657 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A2P52657 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A2P52657 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A2P52657 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A2P52657 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A2P52657 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A2P52657 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A2P52657 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A2P52657 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A2P52657 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A2P52657 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A2P52657 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A2P52657 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2A2P52657 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2A2P52657 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2A2P52657 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2A2P52657 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms