Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB28P51157 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB28P51157 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB28P51157 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB28P51157 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB28P51157 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB28P51157 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB28P51157 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB28P51157 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB28P51157 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB28P51157 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB28P51157 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB28P51157 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB28P51157 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB28P51157 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB28P51157 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB28P51157 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB28P51157 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB28P51157 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB28P51157 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB28P51157 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB28P51157 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB28P51157 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB28P51157 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB28P51157 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB28P51157 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB28P51157 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB28P51157 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB28P51157 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB28P51157 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB28P51157 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB28P51157 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB28P51157 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB28P51157 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB28P51157 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB28P51157 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB28P51157 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB28P51157 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB28P51157 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB28P51157 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB28P51157 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB28P51157 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB28P51157 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB28P51157 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB28P51157 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB28P51157 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB28P51157 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB28P51157 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB28P51157 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB28P51157 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB28P51157 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB28P51157 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB28P51157 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB28P51157 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB28P51157 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB28P51157 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB28P51157 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB28P51157 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB28P51157 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB28P51157 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB28P51157 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB28P51157 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB28P51157 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB28P51157 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB28P51157 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB28P51157 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB28P51157 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB28P51157 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB28P51157 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB28P51157 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB28P51157 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB28P51157 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB28P51157 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB28P51157 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB28P51157 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB28P51157 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB28P51157 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB28P51157 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB28P51157 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB28P51157 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB28P51157 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB28P51157 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB28P51157 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB28P51157 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB28P51157 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB28P51157 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB28P51157 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB28P51157 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB28P51157 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB28P51157 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB28P51157 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB28P51157 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB28P51157 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB28P51157 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB28P51157 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB28P51157 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB28P51157 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB28P51157 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB28P51157 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB28P51157 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms