Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms