Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GGCXP38435 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GGCXP38435 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GGCXP38435 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GGCXP38435 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GGCXP38435 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GGCXP38435 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GGCXP38435 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GGCXP38435 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GGCXP38435 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GGCXP38435 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GGCXP38435 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GGCXP38435 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GGCXP38435 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GGCXP38435 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GGCXP38435 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGCXP38435 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGCXP38435 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGCXP38435 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGCXP38435 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGCXP38435 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGCXP38435 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGCXP38435 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGCXP38435 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGCXP38435 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGCXP38435 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGCXP38435 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGCXP38435 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGCXP38435 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGCXP38435 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGCXP38435 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGCXP38435 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGCXP38435 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGCXP38435 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGCXP38435 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GGCXP38435 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGCXP38435 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGCXP38435 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGCXP38435 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGCXP38435 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGCXP38435 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGCXP38435 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGCXP38435 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGCXP38435 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GGCXP38435 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGCXP38435 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGCXP38435 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGCXP38435 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGCXP38435 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGCXP38435 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGCXP38435 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGCXP38435 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGCXP38435 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGCXP38435 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGCXP38435 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GGCXP38435 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGCXP38435 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGCXP38435 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GGCXP38435 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGCXP38435 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGCXP38435 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGCXP38435 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGCXP38435 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GGCXP38435 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGCXP38435 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGCXP38435 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGCXP38435 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GGCXP38435 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGCXP38435 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGCXP38435 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGCXP38435 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGCXP38435 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGCXP38435 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGCXP38435 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGCXP38435 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGCXP38435 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGCXP38435 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GGCXP38435 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGCXP38435 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGCXP38435 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGCXP38435 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GGCXP38435 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGCXP38435 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGCXP38435 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GGCXP38435 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GGCXP38435 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GGCXP38435 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGCXP38435 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGCXP38435 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGCXP38435 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGCXP38435 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGCXP38435 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGCXP38435 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGCXP38435 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGCXP38435 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GGCXP38435 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGCXP38435 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGCXP38435 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGCXP38435 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGCXP38435 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms