Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms