Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms