Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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