Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms